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PRRSV selection report
April 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 40|PRRSV/swine/North_Carolina/28687/2024|NC|2024-03-27 | L1A | 8 |
| 64|PRRSV/swine/Iowa/29885/2024|IA|2024-03-28 | L1C.5 | 2 |
| 32|PRRSV/swine/Iowa/23095/2024|IA|2024-03-06 | L1H | 21 |
| 24|PRRSV/swine/Iowa/25917/2024|IA|2024-03-14 | L1C.2 | 6 |
| 4|PRRSV/swine/Iowa/31455/2024|IA|2024-03-28 | L1C.3 | 15 |
| 2|PRRSV/swine/Iowa/32023/2024|IA|2024-03-27 | L1D | 0 |
| 3|PRRSV/swine/Indiana/32580/2024|IN|2024-03-29 | L5A | 0 |
Details
Lineage: L1A 40|PRRSV/swine/North_Carolina/28687/2024|NC|2024-03-27
Distance to consensus: 8 nt
>40|PRRSV/swine/North_Carolina/28687/2024|NC|2024-03-27
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Lineage: L1C.5 64|PRRSV/swine/Iowa/29885/2024|IA|2024-03-28
Distance to consensus: 2 nt
>64|PRRSV/swine/Iowa/29885/2024|IA|2024-03-28
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Lineage: L1H 32|PRRSV/swine/Iowa/23095/2024|IA|2024-03-06
Distance to consensus: 21 nt
>32|PRRSV/swine/Iowa/23095/2024|IA|2024-03-06
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Lineage: L1C.2 24|PRRSV/swine/Iowa/25917/2024|IA|2024-03-14
Distance to consensus: 6 nt
>24|PRRSV/swine/Iowa/25917/2024|IA|2024-03-14
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Lineage: L1C.3 4|PRRSV/swine/Iowa/31455/2024|IA|2024-03-28
Distance to consensus: 15 nt
>4|PRRSV/swine/Iowa/31455/2024|IA|2024-03-28
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Lineage: L1D 2|PRRSV/swine/Iowa/32023/2024|IA|2024-03-27
Distance to consensus: 0 nt
>2|PRRSV/swine/Iowa/32023/2024|IA|2024-03-27
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Lineage: L5A 3|PRRSV/swine/Indiana/32580/2024|IN|2024-03-29
Distance to consensus: 0 nt
>3|PRRSV/swine/Indiana/32580/2024|IN|2024-03-29
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