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PRRSV selection report
December 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 43|PRRSV/swine/Iowa/117173/2024|IA|2024-11-25 | L1C.5 | 6 |
| 1|PRRSV/swine/Iowa/118508/2024|IA|2024-11-26 | L1C.2 | 8 |
| 2|PRRSV/swine/Nebraska/118629/2024|NE|2024-11-27 | L1H | 30 |
| 77|PRRSV/swine/North_Carolina/111448/2024|NC|2024-11-08 | L1A | 12 |
| 3|PRRSV/swine/Missouri/118188/2024|MO|2024-11-27 | L1D | 0 |
| 6|PRRSV/swine/Iowa/117857/2024|IA|2024-11-27 | L5A | 0 |
Details
Lineage: L1C.5 43|PRRSV/swine/Iowa/117173/2024|IA|2024-11-25
Distance to consensus: 6 nt
>43|PRRSV/swine/Iowa/117173/2024|IA|2024-11-25
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Lineage: L1C.2 1|PRRSV/swine/Iowa/118508/2024|IA|2024-11-26
Distance to consensus: 8 nt
>1|PRRSV/swine/Iowa/118508/2024|IA|2024-11-26
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Lineage: L1H 2|PRRSV/swine/Nebraska/118629/2024|NE|2024-11-27
Distance to consensus: 30 nt
>2|PRRSV/swine/Nebraska/118629/2024|NE|2024-11-27
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Lineage: L1A 77|PRRSV/swine/North_Carolina/111448/2024|NC|2024-11-08
Distance to consensus: 12 nt
>77|PRRSV/swine/North_Carolina/111448/2024|NC|2024-11-08
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Lineage: L1D 3|PRRSV/swine/Missouri/118188/2024|MO|2024-11-27
Distance to consensus: 0 nt
>3|PRRSV/swine/Missouri/118188/2024|MO|2024-11-27
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Lineage: L5A 6|PRRSV/swine/Iowa/117857/2024|IA|2024-11-27
Distance to consensus: 0 nt
>6|PRRSV/swine/Iowa/117857/2024|IA|2024-11-27
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