ISU PRRSView
PRRSV selection report
January 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 8|PRRSV/swine/Iowa/120816/2023|IA|2023-12-29 | L1A | 7 |
| 69|PRRSV/swine/Iowa/117710/2023|IA|2023-12-21 | L1C.5 | 2 |
| 43|PRRSV/swine/Iowa/114735/2023|IA|2023-12-08 | L1C.2 | 6 |
| 18|PRRSV/swine/Iowa/117414/2023|IA|2023-12-20 | L1H | 16 |
| 16|PRRSV/swine/Iowa/118882/2023|IA|2023-12-21 | L5A | 0 |
| 12|PRRSV/swine/Iowa/120759/2023|IA|2023-12-28 | L1D | 0 |
Details
Lineage: L1A 8|PRRSV/swine/Iowa/120816/2023|IA|2023-12-29
Distance to consensus: 7 nt
>8|PRRSV/swine/Iowa/120816/2023|IA|2023-12-29
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Lineage: L1C.5 69|PRRSV/swine/Iowa/117710/2023|IA|2023-12-21
Distance to consensus: 2 nt
>69|PRRSV/swine/Iowa/117710/2023|IA|2023-12-21
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Lineage: L1C.2 43|PRRSV/swine/Iowa/114735/2023|IA|2023-12-08
Distance to consensus: 6 nt
>43|PRRSV/swine/Iowa/114735/2023|IA|2023-12-08
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Lineage: L1H 18|PRRSV/swine/Iowa/117414/2023|IA|2023-12-20
Distance to consensus: 16 nt
>18|PRRSV/swine/Iowa/117414/2023|IA|2023-12-20
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Lineage: L5A 16|PRRSV/swine/Iowa/118882/2023|IA|2023-12-21
Distance to consensus: 0 nt
>16|PRRSV/swine/Iowa/118882/2023|IA|2023-12-21
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Lineage: L1D 12|PRRSV/swine/Iowa/120759/2023|IA|2023-12-28
Distance to consensus: 0 nt
>12|PRRSV/swine/Iowa/120759/2023|IA|2023-12-28
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