ISU PRRSView
PRRSV selection report
January 2025
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 38|PRRSV/swine/North_Carolina/125367/2024|NC|2024-12-18 | L1A | 8 |
| 7|PRRSV/swine/Arizona/121585/2024|AZ|2024-12-05 | L1E | 18 |
| 99|PRRSV/swine/Iowa/125714/2024|IA|2024-12-19 | L1C.5 | 2 |
| 6|PRRSV/swine/Indiana/128125/2024|IN|2024-12-30 | L1H | 31 |
| 45|PRRSV/swine/Iowa/120482/2024|IA|2024-12-11 | L1C.2 | 11 |
| 6|PRRSV/swine/Nebraska/128083/2024|NE|2024-12-27 | L1D | 0 |
| 42|PRRSV/swine/Iowa/124988/2024|IA|2024-12-18 | L5A | 0 |
Details
Lineage: L1A 38|PRRSV/swine/North_Carolina/125367/2024|NC|2024-12-18
Distance to consensus: 8 nt
>38|PRRSV/swine/North_Carolina/125367/2024|NC|2024-12-18
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Lineage: L1E 7|PRRSV/swine/Arizona/121585/2024|AZ|2024-12-05
Distance to consensus: 18 nt
>7|PRRSV/swine/Arizona/121585/2024|AZ|2024-12-05
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Lineage: L1C.5 99|PRRSV/swine/Iowa/125714/2024|IA|2024-12-19
Distance to consensus: 2 nt
>99|PRRSV/swine/Iowa/125714/2024|IA|2024-12-19
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Lineage: L1H 6|PRRSV/swine/Indiana/128125/2024|IN|2024-12-30
Distance to consensus: 31 nt
>6|PRRSV/swine/Indiana/128125/2024|IN|2024-12-30
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Lineage: L1C.2 45|PRRSV/swine/Iowa/120482/2024|IA|2024-12-11
Distance to consensus: 11 nt
>45|PRRSV/swine/Iowa/120482/2024|IA|2024-12-11
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Lineage: L1D 6|PRRSV/swine/Nebraska/128083/2024|NE|2024-12-27
Distance to consensus: 0 nt
>6|PRRSV/swine/Nebraska/128083/2024|NE|2024-12-27
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Lineage: L5A 42|PRRSV/swine/Iowa/124988/2024|IA|2024-12-18
Distance to consensus: 0 nt
>42|PRRSV/swine/Iowa/124988/2024|IA|2024-12-18
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