ISU PRRSView
PRRSV selection report
July 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 96|PRRSV/swine/USA/61046/2024|USA|2024-06-12 | L1C.5 | 4 |
| 22|PRRSV/swine/North_Carolina/63636/2024|NC|2024-06-19 | L1A | 13 |
| 12|PRRSV/swine/Iowa/61713/2024|IA|2024-06-13 | L1C.2 | 3 |
| 17|PRRSV/swine/Iowa/65544/2024|IA|2024-06-25 | L5A | 0 |
| 12|PRRSV/swine/Iowa/61435/2024|IA|2024-06-18 | L1H | 13 |
| 1|PRRSV/swine/Iowa/66519/2024|IA|2024-06-26 | L1D | 0 |
Details
Lineage: L1C.5 96|PRRSV/swine/USA/61046/2024|USA|2024-06-12
Distance to consensus: 4 nt
>96|PRRSV/swine/USA/61046/2024|USA|2024-06-12
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Lineage: L1A 22|PRRSV/swine/North_Carolina/63636/2024|NC|2024-06-19
Distance to consensus: 13 nt
>22|PRRSV/swine/North_Carolina/63636/2024|NC|2024-06-19
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Lineage: L1C.2 12|PRRSV/swine/Iowa/61713/2024|IA|2024-06-13
Distance to consensus: 3 nt
>12|PRRSV/swine/Iowa/61713/2024|IA|2024-06-13
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Lineage: L5A 17|PRRSV/swine/Iowa/65544/2024|IA|2024-06-25
Distance to consensus: 0 nt
>17|PRRSV/swine/Iowa/65544/2024|IA|2024-06-25
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Lineage: L1H 12|PRRSV/swine/Iowa/61435/2024|IA|2024-06-18
Distance to consensus: 13 nt
>12|PRRSV/swine/Iowa/61435/2024|IA|2024-06-18
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Lineage: L1D 1|PRRSV/swine/Iowa/66519/2024|IA|2024-06-26
Distance to consensus: 0 nt
>1|PRRSV/swine/Iowa/66519/2024|IA|2024-06-26
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