ISU PRRSView
PRRSV selection report
March 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 4|PRRSV/swine/Iowa/19762/2024|IA|2024-02-28 | L1C.2 | 4 |
| 1|PRRSV/swine/Iowa/20528/2024|IA|2024-02-29 | L1C.5 | 5 |
| 58|PRRSV/swine/Iowa/14941/2024|IA|2024-02-14 | L1A | 4 |
| 23|PRRSV/swine/Indiana/16203/2024|IN|2024-02-16 | L5A | 0 |
| 1|PRRSV/swine/Missouri/20511/2024|MO|2024-02-28 | L1D | 0 |
| 1|PRRSV/swine/Oklahoma/20595/2024|OK|2024-02-29 | L1H | 26 |
Details
Lineage: L1C.2 4|PRRSV/swine/Iowa/19762/2024|IA|2024-02-28
Distance to consensus: 4 nt
>4|PRRSV/swine/Iowa/19762/2024|IA|2024-02-28
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Lineage: L1C.5 1|PRRSV/swine/Iowa/20528/2024|IA|2024-02-29
Distance to consensus: 5 nt
>1|PRRSV/swine/Iowa/20528/2024|IA|2024-02-29
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Lineage: L1A 58|PRRSV/swine/Iowa/14941/2024|IA|2024-02-14
Distance to consensus: 4 nt
>58|PRRSV/swine/Iowa/14941/2024|IA|2024-02-14
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Lineage: L5A 23|PRRSV/swine/Indiana/16203/2024|IN|2024-02-16
Distance to consensus: 0 nt
>23|PRRSV/swine/Indiana/16203/2024|IN|2024-02-16
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Lineage: L1D 1|PRRSV/swine/Missouri/20511/2024|MO|2024-02-28
Distance to consensus: 0 nt
>1|PRRSV/swine/Missouri/20511/2024|MO|2024-02-28
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Lineage: L1H 1|PRRSV/swine/Oklahoma/20595/2024|OK|2024-02-29
Distance to consensus: 26 nt
>1|PRRSV/swine/Oklahoma/20595/2024|OK|2024-02-29
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