ISU PRRSView
PRRSV selection report
May 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 11|PRRSV/swine/Iowa/42297/2024|IA|2024-04-26 | L1C.2 | 3 |
| 30|PRRSV/swine/Iowa/34671/2024|IA|2024-04-05 | L1H | 18 |
| 1|PRRSV/swine/Iowa/47886/2024|IA|2024-04-23 | L1D | 0 |
| 13|PRRSV/swine/North_Carolina/44577/2024|NC|2024-04-30 | L1A | 9 |
| 25|PRRSV/swine/Ohio/42328/2024|OH|2024-04-26 | L5A | 0 |
| 224|PRRSV/swine/Iowa/34910/2024|IA|2024-04-09 | L1C.5 | 4 |
Details
Lineage: L1C.2 11|PRRSV/swine/Iowa/42297/2024|IA|2024-04-26
Distance to consensus: 3 nt
>11|PRRSV/swine/Iowa/42297/2024|IA|2024-04-26
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Lineage: L1H 30|PRRSV/swine/Iowa/34671/2024|IA|2024-04-05
Distance to consensus: 18 nt
>30|PRRSV/swine/Iowa/34671/2024|IA|2024-04-05
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Lineage: L1D 1|PRRSV/swine/Iowa/47886/2024|IA|2024-04-23
Distance to consensus: 0 nt
>1|PRRSV/swine/Iowa/47886/2024|IA|2024-04-23
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Lineage: L1A 13|PRRSV/swine/North_Carolina/44577/2024|NC|2024-04-30
Distance to consensus: 9 nt
>13|PRRSV/swine/North_Carolina/44577/2024|NC|2024-04-30
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Lineage: L5A 25|PRRSV/swine/Ohio/42328/2024|OH|2024-04-26
Distance to consensus: 0 nt
>25|PRRSV/swine/Ohio/42328/2024|OH|2024-04-26
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Lineage: L1C.5 224|PRRSV/swine/Iowa/34910/2024|IA|2024-04-09
Distance to consensus: 4 nt
>224|PRRSV/swine/Iowa/34910/2024|IA|2024-04-09
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