ISU PRRSView
PRRSV selection report
November 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 30|PRRSV/swine/Iowa/101142/2024|IA|2024-10-09 | L1C.2 | 8 |
| 5|PRRSV/swine/Iowa/107451/2024|IA|2024-10-31 | L1H | 25 |
| 15|PRRSV/swine/Indiana/106662/2024|IN|2024-10-29 | L1A | 7 |
| 22|PRRSV/swine/Iowa/107943/2024|IA|2024-10-31 | L1C.5 | 4 |
| 3|PRRSV/swine/Iowa/107593/2024|IA|2024-10-29 | L1D | 0 |
| 7|PRRSV/swine/Iowa/108335/2024|IA|2024-10-30 | L5A | 0 |
Details
Lineage: L1C.2 30|PRRSV/swine/Iowa/101142/2024|IA|2024-10-09
Distance to consensus: 8 nt
>30|PRRSV/swine/Iowa/101142/2024|IA|2024-10-09
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Lineage: L1H 5|PRRSV/swine/Iowa/107451/2024|IA|2024-10-31
Distance to consensus: 25 nt
>5|PRRSV/swine/Iowa/107451/2024|IA|2024-10-31
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Lineage: L1A 15|PRRSV/swine/Indiana/106662/2024|IN|2024-10-29
Distance to consensus: 7 nt
>15|PRRSV/swine/Indiana/106662/2024|IN|2024-10-29
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Lineage: L1C.5 22|PRRSV/swine/Iowa/107943/2024|IA|2024-10-31
Distance to consensus: 4 nt
>22|PRRSV/swine/Iowa/107943/2024|IA|2024-10-31
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Lineage: L1D 3|PRRSV/swine/Iowa/107593/2024|IA|2024-10-29
Distance to consensus: 0 nt
>3|PRRSV/swine/Iowa/107593/2024|IA|2024-10-29
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Lineage: L5A 7|PRRSV/swine/Iowa/108335/2024|IA|2024-10-30
Distance to consensus: 0 nt
>7|PRRSV/swine/Iowa/108335/2024|IA|2024-10-30
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