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PRRSV selection report
October 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 36|PRRSV/swine/Iowa/93930/2024|IA|2024-09-23 | L1C.5 | 4 |
| 61|PRRSV/swine/Iowa/88746/2024|IA|2024-09-04 | L1A | 13 |
| 11|PRRSV/swine/Iowa/91376/2024|IA|2024-09-13 | L1H | 24 |
| 2|PRRSV/swine/Colorado/96727/2024|CO|2024-09-26 | L5A | 0 |
| 13|PRRSV/swine/USA/91143/2024|USA|2024-09-11 | L1C.2 | 7 |
| 3|PRRSV/swine/USA/96739/2024|USA|2024-09-26 | L1D | 0 |
Details
Lineage: L1C.5 36|PRRSV/swine/Iowa/93930/2024|IA|2024-09-23
Distance to consensus: 4 nt
>36|PRRSV/swine/Iowa/93930/2024|IA|2024-09-23
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Lineage: L1A 61|PRRSV/swine/Iowa/88746/2024|IA|2024-09-04
Distance to consensus: 13 nt
>61|PRRSV/swine/Iowa/88746/2024|IA|2024-09-04
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Lineage: L1H 11|PRRSV/swine/Iowa/91376/2024|IA|2024-09-13
Distance to consensus: 24 nt
>11|PRRSV/swine/Iowa/91376/2024|IA|2024-09-13
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Lineage: L5A 2|PRRSV/swine/Colorado/96727/2024|CO|2024-09-26
Distance to consensus: 0 nt
>2|PRRSV/swine/Colorado/96727/2024|CO|2024-09-26
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Lineage: L1C.2 13|PRRSV/swine/USA/91143/2024|USA|2024-09-11
Distance to consensus: 7 nt
>13|PRRSV/swine/USA/91143/2024|USA|2024-09-11
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Lineage: L1D 3|PRRSV/swine/USA/96739/2024|USA|2024-09-26
Distance to consensus: 0 nt
>3|PRRSV/swine/USA/96739/2024|USA|2024-09-26
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