ISU PRRSView
PRRSV selection report
September 2024
Recommended Reference Strains
| Strain | Lineage | Distance to Consensus |
|---|---|---|
| 7|PRRSV/swine/Iowa/84238/2024|IA|2024-08-21 | L1C.2 | 1 |
| 55|PRRSV/swine/Minnesota/84941/2024|MN|2024-08-28 | L1C.5 | 5 |
| 24|PRRSV/swine/Iowa/80223/2024|IA|2024-08-09 | L1H | 25 |
| 1|PRRSV/swine/North_Carolina/88502/2024|NC|2024-08-30 | L5A | 0 |
| 49|PRRSV/swine/North_Carolina/81437/2024|NC|2024-08-14 | L1A | 7 |
| 6|PRRSV/swine/Iowa/87056/2024|IA|2024-08-28 | L1D | 0 |
Details
Lineage: L1C.2 7|PRRSV/swine/Iowa/84238/2024|IA|2024-08-21
Distance to consensus: 1 nt
>7|PRRSV/swine/Iowa/84238/2024|IA|2024-08-21
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Lineage: L1C.5 55|PRRSV/swine/Minnesota/84941/2024|MN|2024-08-28
Distance to consensus: 5 nt
>55|PRRSV/swine/Minnesota/84941/2024|MN|2024-08-28
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Lineage: L1H 24|PRRSV/swine/Iowa/80223/2024|IA|2024-08-09
Distance to consensus: 25 nt
>24|PRRSV/swine/Iowa/80223/2024|IA|2024-08-09
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Lineage: L5A 1|PRRSV/swine/North_Carolina/88502/2024|NC|2024-08-30
Distance to consensus: 0 nt
>1|PRRSV/swine/North_Carolina/88502/2024|NC|2024-08-30
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Lineage: L1A 49|PRRSV/swine/North_Carolina/81437/2024|NC|2024-08-14
Distance to consensus: 7 nt
>49|PRRSV/swine/North_Carolina/81437/2024|NC|2024-08-14
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Lineage: L1D 6|PRRSV/swine/Iowa/87056/2024|IA|2024-08-28
Distance to consensus: 0 nt
>6|PRRSV/swine/Iowa/87056/2024|IA|2024-08-28
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